نشأت مدينة القنفذة في بداية القرن الثامن الهجري وتحديدا في عام 709هـ – 1311م وفقا للمصادر التاريخية، ومنذ أقدم العصور كان الشريط الساحلي الشرقي الموازي للبحر الأحمر من الطرق البرية المشهورة التي ترتاده قوافل التجارة البرية من اليمن إلى الشام، وبالعكس محملة بأصناف التجارة العالمية.

وفي القرن الثالث عشر كانت منطلقاً لحملات محمد علي باشا الحربية على عسير، كما أنها كانت ميداناً لتطاحن القوى المتصارعة من العثمانيين والإيطاليين، ولا تزال هناك شواهد من السفن الحربية غارقة في مياه البحر الأحمر جنوبي القنفذة ة جراء قصف البوارج الإيطالية. كما أنها كانت قاعدة لحملات العثمانيين وحلفائهم الأشراف على عسير وقد سميت سابقا بـ(البندر) من قبل العثمانيين، والتي تعني (السوق) باللغة التركية.